I programmet ingår återkommande undersökningar av länets bottensediment. På bottnarna ackumuleras tillförda miljögifter, vilket har lett till att analys av sedimentprover har blivit ett betydelsefullt verktyg i det svenska miljöövervakningsarbetet. Provtagning av sediment genomförs vart 5:e år på 31 stationer, och proverna analyser med fokus på tungmetaller (bl a bly, kvicksilver, zink, koppar, nickel och kadmium). Utanför Mönsterås saknas lämpliga ackumulationsbottnar för provtagning, och där har undersökningen genomförts med hjälp av en standardiserad metod med sedimentfällor.

Tungmetaller i levande organismer

Provtagningsprogrammet för analys av tungmetaller och PAH (polyaromatiska kolväten) i blåmusslor omfattar totalt 17 stationer. På 9 av dessa analyseras även blåstång med avseende på tungmetaller. Fem av stationerna är referensstationer som analyseras varje år medan övriga analyseras vartannat år. Flera av stationerna har undersökts sedan den samordnade provtagningen inleddes 1984 medan några kom till 1995. Under 2009 genomfördes en utökad provtagning av blåmusslor, med syfte att undersöka spridning och förekomst av TBT, bromerade flamskyddsmedel (PBDE) och PAHer. Detta är ett par av de ämnen som enligt Vattendirektivet ska övervakas långs våra kuster.